代谢疾病研究中心：代谢性疾病研究中心是郑州大学先进医学研究中心的一个分中心，也是郑州市肥胖与代谢性疾病重点实验室。在分子、细胞和整体水平上，研究肥胖和二型糖尿病的发病机制和临床治疗手段，与代谢减重外科、内分泌科、消化内科（脂肪肝和胰腺炎）、妇产科（妊娠糖尿病和多囊卵巢综合征）、郑大动物中心等多个科室合作，利用临床样本和转基因小鼠开展肥胖和糖尿病相关研究，为能量过剩性疾病的预防和治疗提供新的理念和靶点。
学科带头人：叶建平，郑州大学特聘教授，博导，曾任美国路易斯安那州立大学终身教授,上海交通大学糖尿病研究所特聘教授及副所长。研究二型糖尿病发病机制，代表工作包括：
（1）在二型糖尿病的发病机制中，提出“线粒体过热”理念，解释胰岛素抵抗和糖代谢紊乱的机制。该理念认为，在能量过剩条件下（如肥胖和老年），线粒体产生的ATP出现供大于求状态，造成内分泌紊乱（胰岛素和胰高血糖素同时增加），从而引起胰岛素抵抗和糖代谢异常，即二型糖尿病。在该理念基础上，进一步提出二型糖尿病是机体对能量过剩的一种代偿反应，其病理生理学意义是将过多的能量物质以糖尿的形式排出体外，从而缓解能量过剩。
（2）在肥胖慢性炎症研究中，提出“脂肪组织缺氧说”解释肥胖炎症的起因和生理学意义。课题组通过动物肥胖模型研究，发现肥胖引起脂肪组织缺氧，通过激活转录因子NF-kB和HIF-1导致脂肪组织慢性炎症。并用转基因小鼠造成的脂肪组织慢性炎症模型，发现该炎症的生理学意义是促进能量代谢和防止脂肪组织过度增生。因此，肥胖慢性炎症也是机体对能量过剩的一种代偿反应，即肥胖慢性炎症是一生理反应，炎症是调节能量代谢的生理机制。
（3）在肥胖治疗中，对手术及药物减肥机制进行了系统研究。发现减重手术的作用依赖于瘦素而不依赖GLP-1；肠道细菌产物“丁酸钠”可以通过增加能量代谢，产生减肥作用，并保护胰岛素敏感性；黄连素通过抑制线粒体呼吸链或细菌呼吸链产生药理作用，如改善糖代谢，减肥降体重，治疗细菌性痢疾，治疗心律失常等。
已发表SCI文章180余篇，引用1.8万余次，H指数65。2022年，在中国（两岸三地）医学领域的高引学者中，排名第153位；在河南省医学领域的高引学者中，排名第2；在郑州大学12家附属医院的高引学者中，排名第1。曾任美国NIH基金常务评审专家，中国自然科学基金二审专家，北美华人糖尿病学会（CADA）主席和副主席。现任“Obesity Medicine”杂志主编，“Acta of Pharmaceutica Sinica B”（IF:14.9）杂志副主编。
近4年发表工作如下：（2017以前的工作见：https://labs.pbrc.edu/generegulation/publications.htm）
1. Liu L, Yan J, Xu H, Zhu Y, Liang H, Pan W, Yao B, Han X, Ye J, Weng J: Two novel microRNA biomarkers related to β-cell damage and their potential values for early diagnosis of type 1 diabetes. J Clin Endocrinol Metab. 103(4):1320-1329, 2018. PMID: 29370422 (IF=5.9)
2. Tang D, Liu L, Ajiakber D, Ye J, Xu J, Xin X and Aisa H: Anti-diabetic Effect of Punica granatum Flower Polyphenols Extract in Type 2 Diabetic Rats: Activation of Akt/GSK-3β and Inhibition of IRE1α-XBP1 Pathways. Frontier in Endocrinology 9:586, 2018. PMID: 30374328 (IF=3.6)
3. Sun Y, Jin C, Zhang X, Jia W, Le J, Ye J: Restoration of GLP-1 secretion by Berberine is associated with protection of colon enterocytes from mitochondrial overheating in diet-induced obese mice. Nutrition & Diabetes 8:53, 2018. PMID: 30250193 (IF=3)
4. Le J, Zhang X, Jia W, Zhang Y, Luo J, Sun Y, and Ye J：Regulation of microbiota-GLP1 axis by sennoside A in diet-induced obese mice. Acta Pharmaceutica Sinica B 9:758-68, 2019. PMID: 31384536 (IF=7)
5. Guo Y, Zhang X, Zhao Z, Lu H, Ke B, Ye X, Wu B and Ye J: NF-кB/HDAC1/SREBP1c pathway mediates the inflammation signal in progression of hepatic steatosis. Acta Pharmaceutica Sinica B 10(5):825-836, 2020. PMID: 32528830 (IF=11.4) ()
6. Wang Y, Zhang J, Cao X, Guan Y, Shen S, Zhong G, Xiong X, Xu Y, Zhang X, Wan H and Ye J: Mitochondrial protein IF1 is a potential regulator of glucagon-like peptide (GLP-1) secretion function of the mouse intestine. Acta Pharmaceutica Sinica B 11:156-1577, 2021. PMID: 34221868 (IF=14.5)
7. Cao X, Ye X, Zhang S, Wang L, Xu Y, Peng S, Zhou Y, Peng Y, Li J, Zhang X, Han X, Huang W, Jia W and Ye J: ADP induces blood glucose through direct and indirect mechanisms in promotion of hepatic gluconeogenesis by elevation of NADH. Frontiers in Endocrinology 12:663530, 2021. PMID: 33986729 (IF=6.0)
8. Xu Y, Peng S, Cao X, Qian S, Shen S, Luo J, Zhang X, Sun H, Shen W, Jia W and Ye J: High doses of butyrate induce a reversible body temperature drop through transient proton leak in mitochondria of brain neurons. Life Sciences 1:278, 2021. PMID: 34022200 （IF=5）
9. Ye J: Mechanism of insulin resistance in obesity: a role of ATP. Frontiers of Medicine 15(3):372-382, 2021. PMID: 34047935（IF=4.5）
10. Zhong G, Zhang J, Guo Y, Wang Y, Wu M, Ren J, Li Y, Zhang X, Zhou B, Zhao W, Lou Y, Wang H, and Ye J: IF1 inactivation attenuates experimental colitis through downregulation of neutrophil infiltration in colon mucosa. International Immunopharmacology 99: 107980, 2021. PMID: 34298397 (IF=4.9)
11. Le J, Fu Y, Han Q, Wei X, Ji H, Chen Y, Wang Q, Pi P, Li J, Lin X, Zhang X, Zhang Y, Ye J: Restoration of mRNA expression of solute carrier proteins in liver of diet-induced obese mice by metformin. Frontiers in Endocrinology 12:720784, 2021. PMID: 34659115 (IF=6.0)
12. Lijun Yin, Man Luo, Ru Wang, Jianping Ye, Xiaohui Wang: Mitochondria in sex hormone-induced disorder of energy metabolism in males and females. Frontiers in Endocrinology 12: 749451, 2021. PMID:34987473 (IF=6.0)
13. Kunpeng Liu, Xiaogao Jin, Xiaoying Zhang, Hongkai Lian and Jianping Ye: Nucleotides in mechanism of insulin resistance. Journal of Genetics and Genomics 49(4):299-307, 2022. PMID: 35134563 (IF=5.7)
14. Shiqiao Peng, Xiaoying Zhang, Lili Yu, Yanhong Xu, Yang Zhou, Shengnan Qian, Xinyu Cao, Xiaotong Ye, Jiajun Yang, Weiping Jia, Jianping Ye: NF-κB regulates brown adipocyte function through suppression of ANT2. Acta Pharmaceutic Sinica B 12(3):1186-1197, 2022. PMID: 35530146 (IF=14.9).
15. Lili Yu, Xiaoying Zhang, Sarah Ye, Hongkai Lian, Hui Wang and Jianping Ye: Obesity in severe COVID-19: mechanistic insights from adipose tissue. Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism 107(7):1799-1811, 2022. PMID: 35262698 (IF=6.1)
16. Genshen Zhong, Qi Wang, Ying Wang, Ying Guo, Yaya Guan, Xiaoying Zhang, Minna Wu, Zhongxin Zhang, Weidong Zhao, Yinming Liang, Hongkai Lian, Hui Wang, and Jianping Ye: scRNA-seq reveals ATPIF1 activity in control of T cell anti-tumor activity. OncoImmunology 11(1):2114740, 2022. PMID: 36016697 (IF=7.7)
